- オープニング後、外へ出て上の草むらに入り戦闘開始。
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- 戦闘終了後、オーキド研究所へ。最初のポケモン「ピカチュウ」をもらう。ライバルと対戦。
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- 対戦終了後、トキワシティフレンドリショップに行き「おとどけもの」をもらう。
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- オーキド博士に「おとどけもの」を渡し「ポケモン図鑑」をもらう。
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- トキワシティ北部にいるおじさんにポケモンの捕まえ方を習う。
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- トキワの森を抜けニビシティジムへ。ジムリーダーのタケシと対戦し勝利。「グレーバッジ」をもらう。
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- おつきみやまを抜けハナダシティ北部の橋へ。ライバルと対戦。
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- 対戦終了後、ハナダの岬にあるマサキの家へ。分離プログラムイベントを終え「ふねのチケット」をもらう。
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- ハナダシティジムのジムリーダーカスミと対戦し勝利。「ブルーバッジ」をもらう。
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- ハナダシティ民家の外にいるロケット団員と対戦。勝利後、地下通路を抜けクチバシティへ行く。
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- サントアンヌ号の船長室前でライバルと対戦。
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- 対戦終了後、船長に話しかける。「ひでマシン01」をもらう。
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- クチバシティジムのジムリーダーマチスと対戦し勝利。「オレンジバッジ」をもらう。
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- イワヤマトンネルを抜けシオンタウンへ。シオンタウン−地下通路を経由しタマムシシティへ。
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- タマムシシティのジムリーダーエリカと対戦し勝利。「レインボーバッジ」をもらう。
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- タマムシシティゲームコーナーのチラシ前にいるロケット団員と対戦。勝利後、チラシを調べゲームコーナー地下へ。
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- 深奥部にいるロケット団ボス・サカキと対戦し勝利。「シルフスコープ」をもらう。
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- シオウンタウンにあるポケモンタワーでライバルと対戦。勝利後最上階手前で野生のガラガラと対戦。
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- ガラガラと戦闘終了後、最上階でロケット団員と対戦。フジろうじんを救い「ポケモンのふえ」をもらう。
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- タマムシシティ−サイクリングロード経由もしくは、シオンタウン−セキチク東経由でセキチクシティに行く。
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- セキチクシティジムリーダー・キョウと対戦。勝利後、「ピンクバッジ」をもらう。
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- サファリゾーン道中に落ちている「きんのいれば」を入手。深奥ゲストハウスで「ひでマシン03」をもらう。
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- サファリゾーン園長に「きんのいれば」を渡し、「ひでマシン04」をもらう。
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- ヤマブキシティのシルフカンパニーでライバルと対戦。
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- 対戦終了後、シルフカンパニー最上階にいるロケット団ボスと対戦。
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- 対戦終了後、シルフカンパニー社長から「マスターボール」をもらう。
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- グレンタウンのポケモン屋敷深奥部で「ひみつのカギ」を入手。
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- グレンタウンジムリーダー・カツラと対戦。勝利後「クリムゾンバッジ」をもらう。
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- トキワシティジムリーダー・サカキと対戦。勝利後「グリーンバッジ」をもらう。
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- チャンピオンロードを抜け、四天王と対戦。
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- 四天王全員に勝利後、ライバルと対戦。
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- ライバルに勝利後、殿堂入り。エンディング。
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- ポケモン図鑑集め＆最強ポケモン育成等。
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